История образования регионального командования начинается с создания в 1918 году Петроградской  конвойной команды численностью 160 человек, укомплектованной частично из низших чинов, перешедших на сторону революции, и добровольцев из числа революционных рабочих.

В 1923 году с передачей конвойной стражи в войска ОГПУ Петроградская конвойная команда была преобразована в Петроградский конвойный полк. Позднее на его базе была сформирована отдельная бригада войск конвойной стражи СССР. На тот момент в группировку войск НКВД на Северо-Западе кроме неё входили части по охране государственной границы, особо важных промышленных предприятий, железных дорог и части оперативного назначения.

В 20-е и 30-е годы воины внутренних войск обезвреживали банды,  охраняли железнодорожные и водные сообщения, промышленные предприятия и сооружения, имеющие важное значение для страны. 14 декабря 1940 года бригада стала именоваться 41-й бригадой войск НКВД СССР, когда грянула Великая Отечественная война, личный состав войск вместе с воинами  Советской Армии сражался с немецко-фашистскими захватчиками, надёжно охранял  важные государственные объекты, поддерживал общественный порядок в населённых пунктах, боролся со шпионами и диверсантами противника.

С особой стойкостью сражались бойцы внутренних войск под Ленинградом, охраняли его важные объекты, боролись с преступностью на улицах, обеспечивали связь блокадного города со страной по Дороге жизни.

В годы Великой Отечественной войны высшей награды Родины - звания Героя Советского Союза - были удостоены Михаил Ашик и Владимир Сентюрин, служившие впоследствии во внутренних войсках, дислоцированных на Северо-Западе.

Правопреемниками 2-й отдельной бригады в послевоенные годы  стали 47-¬я дивизия конвойных войск НКВД СССР, позже - 5-й отдел конвойной охраны УМВД Ленинградской области, затем - 13-й отдел внутренней и конвойной охраны Министерства охраны общественного порядка (ВКО МООП) СССР.

В феврале 1968 года за образцовое выполнение оперативно-служебных задач дивизия была награждена орденом Красной Звезды и переименована в конвойную дивизию МВД СССР.

По окончанию войны внутренние войска были значительно сокращены, многие части расформированы, а те, которые остались в составе войск, охраняли государственные объекты, выполняли другие служебно-боевые задачи, возложенные на МВД СССР. Среди них  участие в охране общественного порядка в различных регионах страны.

В апреле 1979 года на базе дивизии сформировано ордена Красной Звезды Управление внутренних войск МВД СССР по Северо-Западу и Прибалтике, а с  1991 года - по Северу-Западу.

Первым командующим внутренними войсками, дислоцированными на Северо-Западе, указом  императора Александра I в 1817 году был назначен генерал-майор И.И. Миллер. Уже в наше время, с образованием объединений внутренних войск, ими последовательно командовали генерал-лейтенант А.М. Копанев (с 1979 по 1987 гг.), генерал-лейтенант В.Н. Саввин (с 1987 по 1991 гг.), впоследствии – генерал-полковник, командующий внутренними войсками МВД СССР, генерал-лейтенанты Л.Я. Червоткин (с 1991 по 1998 гг.), А.И. Климентьев (с 1998 по 2002 гг.), А.Г. Львов (с 2002 по 2005 гг.), Ю.Г. Завизионов (с 2005 по 2006 гг.). С 2007 года по н.в. - генерал-лейтенант Павел Петрович Дашков.

С середины 1980-х годов войска неоднократно принимали участие в пресечении нарушений общественного порядка, носящих массовый характер и представляющих угрозу жизни и здоровью граждан, выполняли задачи по разъединению противоборствующих сторон в зонах межнациональных конфликтов.

В 1993 году Управление внутренних войск по Северо-Западу было преобразовано в Северо-Западный округ внутренних войск МВД России. С 1994 по 1998-й годы  осуществлена передача функций по охране исправительно-трудовых учреждений и конвоированию в систему Министерства юстиции. В структуру округа вошли части по охране важных государственных объектов и специальных грузов, образован отряд специального назначения «Ратник».

С 1994 года военнослужащие Северо-Западного округа внутренних войск МВД России принимали участие ликвидации незаконных вооруженных формирований на территории Чеченской Республики. С 1999 года воинские части и подразделения округа участвовали в контртеррористических операциях на территории Северо-Кавказского региона РФ.

За мужество и героизм высшей награды Родины - звания Героя России -  были удостоены пятеро военнослужащих Северо-Западного округа внутренних войск: генерал-майор Геннадий Фоменко, капитан Сергей Бавыкин (посмертно), старший лейтенант Геннадий Кичкайло (посмертно), майор Никита Кульков (посмертно), ефрейтор Игорь Чиликанов (посмертно).

С 1 января 2008 года округ преобразован в Северо-Западное ордена Красной Звезды региональное командование внутренних войск МВД России.

В настоящее время воинские части регионального командования дислоцируются на территории десяти субъектов Российской Федерации.

В состав Северо-Западного регионального командования внутренних войск МВД России входят органы управления, отдельная бригада оперативного назначения, специальные моторизованные воинские части, воинские части по охране важных государственных объектов и специальных грузов, авиационные и морские части, отряд специального назначения, а также учреждения и части обеспечения.